丘陵區

喬木

筆筒樹、水冬瓜、羅氏鹽膚木、山漆、鴨腳木、破布子、杜英、刺杜密、細葉饅頭果、錫蘭饅頭果、血桐、野桐、白匏子、烏臼、樟樹、紅楠、香楠、相思樹、苦楝、構樹、榕樹、稜果榕、島榕、枇杷、賊仔樹、鼠刺、灰木、石朴、山黃麻、麻竹、檳榔

灌木

燈稱花、襾骨消、王爺葵、野牡丹、小葉桑、臺灣山桂花、柚、三腳鱉、米碎旦木、杜紅花、大青、馬櫻丹

藤本

落葵、山葛、山葡萄、菝契

草本

熱帶鱗蓋蕨、芒萁、烏蕨、臺灣澤蘭、半邊羽裂鳳尾蕨、帚馬蘭、大花咸豐草、昭和草、毛蓮菜、加拿大蓬、金腰箭、一支香、野棉花、羽萼懸鉤子、闊葉鴨舌黃舊、姑婆芋、弓果黍、白茅、五節芒、求米草、大黍、桔梗蘭、月桃

河岸及

河川區

草本

五節芒、加拿大蓬、臺灣澤蘭、野茼蒿、甜根子草、掃帚蘭、葎草、狗牙根、狗尾草、蓼、圓果雀椑、扁穗莎草、走莖莎草、李氏禾、錢鋪屬、木賊、水燭、馬藻、水蘊草、聚藻、水龍、漂浮草、短葉水蜈蚣、野古草、鴨跖草、鳳尾草、巴拉草、田字草、槭葉牽牛、豇豆

丘陵區

鳥類

大冠鷲、竹雞、小雲雀、灰鶺領、紅嘴黑鵯、白頭翁、頭烏線、繡眼畫眉、小彎嘴畫眉、大彎嘴畫眉、山頭紅、粉紅鸚嘴、灰頭鷦鶯、褐頭鷦鶯、黑枕鶲、綠繡眼、白腰文鳥、麻雀、樹雀

蝶類

烏鴉鳳蝶、白紋鳳蝶、大琉璃鳳蝶、荷氏黃蝶、端紅蝶、臺灣紋白蝶、小紫班蝶、黑端豹斑蝶、石牆蝶、琉球三線蝶、黃蛺蝶、孔雀紋蛺蝶、波紋小灰蝶

爬蟲類

印度蜓蜥、斯文豪式攀蜥

哺乳類

赤腹松鼠

河岸及

河川區

鳥類

小白鷺、黃頭鷺、白頭翁、褐頭鷦鶯、黑枕藍鶲、綠繡眼、麻雀、班文鳥

蝶類

臺灣紋白蝶

兩棲類

澤蛙

魚類

平頷允、丹氏允、吳郭魚、沙鰍、土豳、川薑虎、大肚魚、短吻鐮柄魚、克氏橋、極樂薑虎、鱸鰻、草魚、鯽魚、羅漢魚、黑鰱